Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms