Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK17Q00537 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms