Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms