Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms