Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD1P98174 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD1P98174 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms