Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms