Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms