Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1A1P68104 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms