Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms