Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms