Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms