Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SNAP25P60880 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms