Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms