Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABP4P57796 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABP4P57796 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABP4P57796 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms