Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms