Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms