Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BGRP55822 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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