Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52P55327 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPD52P55327 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TPD52P55327 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TPD52P55327 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TPD52P55327 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TPD52P55327 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TPD52P55327 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TPD52P55327 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms