Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms