Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms