Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms