Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms