Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NESP48681 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NESP48681 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NESP48681 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NESP48681 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NESP48681 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NESP48681 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms