Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX2P48431 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX2P48431 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX2P48431 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX2P48431 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX2P48431 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms