Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms