Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms