Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPOP42166 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms