Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms