Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms