Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBRP36941 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms