Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms