Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms