Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms