Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB2P29033 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB2P29033 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms