Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP1P28562 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP1P28562 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms