Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APCP25054 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APCP25054 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APCP25054 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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