Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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