Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms