Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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