Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HRCP23327 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HRCP23327 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HRCP23327 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HRCP23327 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms