Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms