Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms