Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF1P22415 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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