Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1P21675 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms