Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NTF3P20783 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NTF3P20783 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms