Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms