Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CCL3L1P16619 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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