Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms