Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms