Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms